Реферат: Зрительные молекулы - текст реферата. Скачать бесплатно.
Банк рефератов, курсовых и дипломных работ. Много и бесплатно. # | Правила оформления работ | Добавить в избранное
 
 
   
Меню Меню Меню Меню Меню
   
Napishem.com Napishem.com Napishem.com

Реферат

Зрительные молекулы

Банк рефератов / Биология

Рубрики  Рубрики реферат банка

закрыть
Категория: Реферат
Язык реферата: Русский
Дата добавления:   
 
Скачать
Архив Zip, 465 kb, скачать бесплатно
Обойти Антиплагиат
Повысьте уникальность файла до 80-100% здесь.
Промокод referatbank - cкидка 20%!

Узнайте стоимость написания уникальной работы

О.В. Мосин


ЗРИТЕЛЬНЫЕ МОЛЕКУЛЫ.


Много лет назад американский биохимик У. Раштон пи­сал: «Молекулы реагируют на свет так же, как люди на музыку. Некото­рые не воспринимают ничего. Другие начинают слегка постукивать ногой или пальцем. Есть и такие, кто поднимается, танцует и меняет партнеров». В те времена Раштон мог дать лишь такое поэтическое описание: не было известно, какие конкретно молекулы участвуют в ответе фоторецепторных клеток сетчатки на свет и как они взаимодействуют .

Однако в последнее десятилетие во многих лабораториях получены экспериментальные данные, раскрывающие молекулярные основы зрительного возбуждения. Идентифицированы молекулы, принимающие участие в реакции на свет, составлена в основном схема их взаимодействия. Биохимиче­ские исследования показали, что молекулы, обеспечивающие ответ на свет, действительно «поднимаются, танцуют и меняют партнеров» в каскаде реакций, лежа­щем в основе механизма зрения.

Этот молекулярный каскад имеет определенную локализацию в фоторецепторных клетках сетчатки. Фоторецепторные клетки бывают двух типов, которые за их характерную форму называются палочками и кол­бочками. Палочки позволяют видеть черно-белые изображения при туск­лом свете; колбочки осуществляют цветовое зрение при ярком свете. Сет­чатка человека содержит 3 млн. кол­бочек и 100 млн. палочек. Электриче­ские сигналы, генерируемые колбоч­ками и палочками, обрабатываются другими клетками сетчатки, прежде чем передаются в мозг по зрительному нерву.

Надо сказать, что как рецепторы палочки достигли предельной чувствительности. Палочка может быть возбуждена одним фотоном — наи­меньшим возможным количеством света. Каскад молекулярных взаимо­действий усиливает этот крошечный «квант» информации в сигнал, кото­рый воспринимается нервной систе­мой. Кроме того, степень усиления изменяется в зависимости от фонового освещения: палочки более чувствительнее при тусклом свете, чем при ярком. В результате они эффективно функционируют в широком диапазоне фонового освещения. При этом сенсорная система палочек упакована в хо­рошо различимые клеточные субструктуры, которые можно легко вы­делить и исследовать.

Палочка представляет собой длинную тонкую клетку, разграниченную на две части. Наружный сег­мент клетки содержит большую часть молекулярного механизма, детектирующего свет и инициирующего нерв­ный импульс. Внутренний сегмент специализируется на генерации энергии и обновлении молекул, необходи­мых в наружном сегменте. Помимо этого, внутренний сегмент формиру­ет синаптическое окончание, которое служит для связи с другими клетками. Если изолированную сетчатку слегка потрясти, наружные сегменты пало­чек отпадают и весь аппарат возбуж­дения можно исследовать в высоко­очищенном виде. Это свойство пало­чек делает их настоящим подарком для биохимиков. Наружный сегмент палочки — это узкая трубка, заполненная стопкой тонких дисков; в одной.клетке их при­мерно 2 тысячи. И трубка, и диски об­разованы двухслойной мембраной од­ного и того же типа.

Но наружная (плазматическая) мембрана палочки и мембрана дисков имеют различные функции в рецепции света и генерации нервного импульса. Диски содержат большинство белковых молекул, участвующих в поглощении света и инициации возбуждающего ответа. Наружная мембрана служит для пре­образования химического сигнала в электрический.

К числу наиболее важных моле­кул, связанных с мембраной дис­ков, относится родопсин. Это фоторецепторный белок палочек, который поглощает фотон и дает ответ, со­ставляющий первый шаг в цепи собы­тий, обеспечивающих зрение. Родоп­син состоит из двух компонентов — органического соединения, называе­мого 1l-цис-ретиналем, и белка опсина. 11-цис-ретиналь — производное витамина А. Опсин способен функцио­нировать как фермент. Поглощение фотона 11-цис-оретиналем «включает» ферментативную активность опсина и приводит в действие биохимический каскад.

Молекула опсина представляет собой единую полипептидную цепь из 348 остатков аминокислот. Амино­кислотная последовательность опси­на определена нашими отечественными учёными в лаборатори­ях Ю.А. Овчинникова в Институте биоорганической химии им. М.М. Шемякина в Москве.

В этих исследованиях получена сущест­венная информация о трехмерной структуре этого важного белка, пронизываю­щего мембрану диска. Оказалось, что полипептидная цепь опсина образует семь участков так называемой альфа-спирали, которые расположены поперек мембраны; альфа-спиральные сегмен­ты соединены короткими неспиральными участками. С одной из альфа-спиралей связана молекула 11-цис-ретиналя, располо­женная вблизи от середины мембра­ны так, что ее длинная ось параллель­на поверхности мембраны. Таким об­разом ретиналь вмонтирован в центр сложного, высокоорганизованного белкового окружения. Это окружение обеспечивает «подстройку» ретиналя, влияя на спектр его поглощения. Сам по себе свободный ретиналь в растворенном виде имеет максимум поглощения в ультрафиолетовой об­ласти спектра — на длине волны 380 нм, в то время как родопсин по­глощает зеленый свет на 500 нм. Этот сдвиг замечателен с функциональной точки зрения: благодаря ему спектр поглощения родопсина приво­дится в соответствие со спектром све­та, попадающего в глаз.

Что же происходит, когда 11-цис-ретиналь поглощает фотон? В общем виде ответ состоит в том, что молекула изомеризуется. Изомерами называются соединения, одинаковые по составу, но различающиеся по форме. Приставка «11 -цис» обозначает определенный изомер ретиналя. «Скелет» молекулы ретиналя образо­ван цепочкой атомов углерода; «11-цис» означает, что атомы водорода, соединенные с 11-м и 12-м атомами углерода, расположены с одной и той же стороны от этой цепочки. При та­кой конфигурации в этом месте углеродной цепи имеется изгиб. В другом изомере, называемом ол-транс (т. е. полностью транс, атомы водорода при 11-ми 12-м атомах углерода ле­жат друг против друга, и углеродный скелет распрямлен.


ЦИКЛИЧЕСКИЙ 3'—5'-гуанозинмонофосфат (cGMP) в палочках сетчатки служит внутриклеточным медиатором, обеспечивая генерацию нервного импульса. В состав cGMP входят атомы азота (темно-синие), углерода (голубые), кислорода (красные), водорода (белые) и фосфора (желтые). Атом фосфора является частью кольцевой структуры, из-за которой соединение и называется циклическим. Пока это кольцо цело, cGMP поддерживает от­крытое состояние натриевых каналов в наружной мембра­не палочки. Когда же оно размыкается (под действием специального фермента), натриевые каналы закрывают­ся, в результате чего электрические свойства мембраны изменяются и возникает нервный импульс.



Еще в 1957 году Дж. Уолд и Р. Хаббард из Гарвардского университета установили, в чем заключается пер­вичное молекулярное событие в про­цессе зрительного восприятия. Они показали, что при поглощении фото­на 11 –цис-ретиналь переходит в фор­му ол-транс. Энергия света распрям­ляет изгиб цепи между 11-м и 12-м атомами углерода. Родопсин очень чувствителен к такому воздействию: поглощение фотона в половине случа­ев вызывает изомеризацию. Спонтан­ная же изомеризация молекулы ретиналя в темноте происходит приблизи­тельно раз в 1000 лет. Такое различие имеет важное следствие для зрения. Когда фотон попадает на сетчатку, поглотившая его молекула родопсина «сообщает» об этом с высокой эффек­тивностью, в то время как миллионы других молекул родопсина в клетке остаются «безмолвными».

Десятилетие спустя был достигнут определенный прогресс в понимании того, что происходит на последнем этапе каскада возбуждения — на на­ружной мембране. Дело в том, что плазматическая мембрана клетки избирательно проницаема для электрически заряженных частиц, вследствие чего существует разность электрических потенциалов между внутренней и наружной стороной клетки. В состоянии покоя внутрен­няя часть клетки несет отрицатель­ный заряд около 40 мВ по отношению к наружной. В 1970 годах учёными было показано, что после освещения разность потенциа­лов на мембране палочки увеличива­ется. Это увеличение зависит от ин­тенсивности стимула и фонового ос­вещения; максимальная разность потенциалов составляет —80 мВ.

Увеличение разности потенциалов, называемое гиперполяризацией, происходит вследствие уменьшения проницаемости мембраны для ионов натрия (которые несут положительный заряд). После того как в общих чертах была установлена природа гиперполяризации, было показано что поглощение одного фотона приводит к тому, что в плазма­тической мембране палочки закрыва­ются сотни натриевых каналов, бло­кируя вход миллионов ионов натрия. Возникнув под действием света, гиперполяризация затем распростра­няется по наружной мембране палоч­ки на другой конец клетки к синапти­ческому окончанию, где возникает нервный импульс.

Эти фундаментальные исследова­ния позволили создать представление о том, что происходит в начале и кон­це биохимического каскада, но оста­вили нерешенным вопрос: а что же происходит посередине? Каким об­разом изомеризация ретиналя в мем­бране диска приводит к закрыванию натриевых каналов в наружной кле­точной мембране? В палочках плаз­матическая мембрана не соприкасает­ся с мембраной дисков. Значит, пере­дача сигнала от дисков к наружной мембране должна осуществляться с помощью какого-то посредника. Притом, поскольку один фотон мо­жет вызывать закрывание сотен на­триевых каналов, каждый акт погло­щения фотона должен сопровождать­ся образованием множества молекул посредника.

Что же является внутриклеточным медиатором возбуждающего сигнала? В 1973 году учёные предположили, что в темноте в диске запасаются ионы кальция, а при освещении они высвобождаются и, дости­гая путем диффузии плазматической мембраны, закрывают натриевые ка­налы. Эта привлекательная гипотеза вызвала большой интерес и породила множество экспериментов. Однако последующие работы учёных показали, что, хотя ионы кальция и играют большую роль в зрении, они не являются воз­буждающим медиатором. Роль меди­атора, как выяснилось, играет соеди­нение, называемое 3', 5'-циклическим гуанозинмонофосфатом, или сокращенно cGMP.

Способность cGMP функционировать в качестве медиатора тесно свя­зана с его химической структурой. GMP — это нуклеотид того типа, ко­торый представлен в РНК. Как и дру­гие нуклеотиды, он состоит из двух компонентов: азотистого основания, в данном случае гуанина, и остатка пятиуглеродного сахара рибозы. (Нуклеотиды, содержащие гуанин, назы­вают в целом гуаниловыми нуклеотидами.) Слово «циклический» означа­ет, что атомы углерода в остатке рибозы, обозначаемые 3' и 5', соеди­нены через фосфатную группу. Связь между этими двумя атомами, называемая фосфодиэфирной связью, замыкает молекулу в кольцо. Когда это кольцо целое, cGMP способен поддер­живать натриевые каналы мембраны в открытом состоянии, а когда фосфодиэфирная связь расщепляется фер­ментом фосфодиэстеразой, натрие­вые каналы спонтанно закрываются.


МОЛЕКУЛА РОДОПСИНА, встроенная в мембрану диска, воспринимает свет и инициирует каскад возбуждения. Мембрана диска, как и плазматическая мембрана клетки, из которой она происходит, образована двойным слоем молекул липидов. Родопсин состоит из двух компонентов: низкомолекулярного соединения, называемого 11-цис-ретиналем, и белка опсина. Полипептидная цепь опсина уложена в семь альфа-спиралей, соединенных короткими неспирапьными участками; «-спиральные сегменты пересе­кают мембрану. 11-цис-ретиналь (красный) присоединен к одной из спиралей вблизи середины мембраны. Поглощение кванта света ретиналем приводит к изменению его формы и активации родопсина. Эта модель структуры родопсина предложена американскими учёными Э. Драцем и П. Харгрэйвом.


Между возбуждением родопсина и ферментативным расщепле­нием cGMP есть несколько промежуточных стадий. Когда ретиналь по­глощает фотон и активируется опсин, родопсин в свою очередь активирует фермент, называемый трансдуцином. Трансдуцин является ключевым интермедиатом в каскаде возбуждения. Этот белок активирует специфическую фосфодиэстеразу, которая раскрывает кольцо cGMP, присоединяя к нему молекулу воды (т. е. осуществляя гидролиз). Хотя схему этого пути описать несложно, выяснение и пони­мание его физиологической роли по­требовали множества разнообразных экспериментов.

В 1971 году учёные обнаружили, что на све­ту значительно уменьшается концент­рация cGMP в наружных сегментах палочек. Последующие эксперимен­ты показали, что это уменьшение — следствие гидролиза cGMP под дейст­вием фосфодиэстеразы, специфичной к данному нуклеотиду. В то время кальциевая гипотеза была еще очень популярна, однако уже не вызывало сомнений и то, что cGMP обладает значительным прямым влиянием на возбуждающий ответ.

На конференции, проходившей в 1978 г., П. Либман из Пенсильванского университета сообщил, что в суспензии наружных сегментов палочек один фотон может иницииро­вать активацию сотен молекул фос­фодиэстеразы в секунду. В более ран­них работах в присутствии другого нуклеотида — аденозинтрифосфата (АТР) наблюдалось гораздо меньшее усиление. По данным учёных, значительное усиление достигается в присутствии гуанозинтрифосфата (GTP).


РЕТИНАЛЬ ИЗМЕНЯЕТ ФОРМУ в результате поглощения фотона. В 11-цис-ретинале вверху атомы водорода при 11-м и 12-м атомах углерода расположе­ны с одной и той же стороны от углеродного скелета, так что в этом месте име­ется изгиб. В форме цис-ретиналь существует в темноте. Поглощение фотона вызывает вращение вокруг связи между 11-м и 12-м атомами углерода и образу­ется изомерная форма — ол-транс-ретинапь (внизу) без изгиба.


КОЛЬЦО циклического гуанозинмонофосфата (cGMP), которое образовано фосфатной группой, связанной с З'-и5'-углеродными атомами рибозы, размы­кается под действием специфичной фосфодиэстеразы. Этот фермент присое­диняет к cGMP молекулу воды так, что фосфодиэфирная связь рвется и оста­ется просто 5'-гуанозинмонофосфат (5'-GMP).


Гуанозинтрифосфат имеет такую же структуру, как нециклическая форма GMP, но в GTP с 5' -углеродным атомом связана не одна фосфатная группа, а цепочка из трех фосфатов, соединенных друг с другом фосфодиэфирными связями. Энергия, запасен­ная в этих связях, используется во многих клеточных функциях. Напри­мер, при отщеплении от GTP одной фосфатной группы (при этом образуется гуанозиндифосфат, GDP) выде­ляется значительное количество энер­гии. Таким путем клетка получает энергию, позволяющую осущест­влять химические реакции, которые иначе энергетически невыгодны. Также важно то, что этот процесс, по-видимому, имеет место при активации фосфодиэстера­зы, где GTP служит необходимым кофактором.

Другим американским учёным Миллеру и Г. Николу удалось инъецировать cGMP в наружный сегмент интактной палочки, и результаты этого оказались поистине впечатляющими. Как только циклический гуанозинмонофосфат попадал внутрь клет­ки, быстро уменьшалась разность по­тенциалов на плазматической мем­бране и резко увеличивалась задержка между подачей светового стимула и гиперполяризацией мембраны. Проще всего эти факты объяснить тем, что cGMP открывает натриевые кана­лы и они остаются открытыми до тех пор, пока cGMP не распадется под действием активированной светом фосфодиэстеразы. В то время эта гипотеза казалась весьма привлекательной, но прямых ее доказа­тельств не было.

В теоретических выкладках существенное значение имел тот факт, что для ее активации необхо­дим GTP. Это позволяло предполагать, что важным интермедиатом ак­тивации может быть какой-то белок, связывающий GTP. Следовало тща­тельно рассмотреть, что же происходит с GTP в палочках. Целью первых экспериментов учёных было обнару­жить связывание GTP и его производных в наружных сегментах палочек. Меченный радиоактивным изотопом GTP инкубировали с фрагментами на­ружных сегментов палочек. После не­скольких часов препарат промывали на фильтре, задерживающем фраг­менты мембран и крупные молекулы, такие, как белки, и пропускающем мелкие молекулы, в том числе GTP и родственные ему соединения. Оказалось, что значительная часть радио­активности остается связанной с мем­бранной фракцией. В дальнейшем выяснилось, однако, что в мембране остается не GTP, a GDP.

Эти данные убедительно свидетельствовали, что в мембранах пало­чек содержится белок, способный свя­зывать GTP и отщеплять от него одну фосфатную группу с образованием GDP. Казалось все более вероятным, что такой белок — ключевой интермедиат и что превращение GTP в GDP может приводить в действие процесс активации.

Одним из поразительных фактов было то, что мембраны палочек не только связывают гуаниловые нуклеотиды, но при освещении из них высвобождается GDP, причем этот процесс значительно усиливается в присутствии GTP в окружающем растворе. Начала вырисовываться гипотеза, организующая этот, казалось бы, беспорядочный набор сведений. По-видимому, какой-то этап процес­са активации включает в себя обмен GTP на GDP в мембране. Поэтому высвобождение GDP так сильно и увеличивается при добавлении GTP: GDP должен замещаться GTP. В дальнейшем GTP, возможно, превра­щается в GDP.

Вероятно, об­мен GTP на GDP имеет отношение к центральному событию процесса ак­тивации. Прежде всего, этот обмен происходит с большим усилием. Учёные исследовали действие света на погло­щение GTP мембранами палочек и обнаружили, что фотовозбуждение од­ной молекулы родопсина приводит к связыванию около 500 молекул анало­га GTP. Открытие этого усиления стало важным шагом на пути к объяснению уси­ления, присущего каскаду возбужде­ния в целом.

Этот фундаментальный результат привел учёных к предположению, что в каскаде возбуждения участвует белко­вый интермедиат, существующий в двух состояниях. В одном состоянии он связывает GDP, в другом — GTP. Обмен GDP на GTP, служащий сигна­лом к активации белка, инициируется родопсином и в свою очередь активи­рует специфическую фосфодиэстера­зу. Фосфодиэстераза расщепляет циклический GMP, вследствие чего за­крываются натриевые каналы в плаз­матической мембране. Вскоре этот предпо­лагаемый белок был выделен. Он получил название трансдуцин, так как опосредует трансдукцию — преобразование све­та в электрический сигнал. Впоследствии было установлено, что трансдуцин состоит из трех белковых субъединиц; их обозначают альфа, бета , и гамма.

Сигнал передается от активированного родопсина к трансдуцину и от его GTP-формы к фосфо-диэстеразе. Если такая картина верна, следует ожидать, во первых, что трансдуцин может переходить в GTP-форму в отсутствие фосфодиэстера-зы, и, во-вторых, что фосфодиэстераза способна активироваться без возбужденного светом родопсина.

Для провер­ки первого предположения учёные использовали синтети­ческую мембранную систему, не со­держащую фосфодиэстеразы. На ис­кусственную мембрану наносили очищенный трансдуцин в GDP-форме, а затем добавляли активированный ро­допсин. В этих опытах было установ­лено, что каждая молекула родопсина катализирует захват мембраной 71 молекулы аналога GTP. Значит, акти­вируя трансдуцин, каждая молекула родопсина катализирует обмен GDP на GTP во множестве молекул трансдуцина. Таким образом, впервые уда­лось обнаружить усилительный эф­фект родопсина, для проявления ко­торого чтобы проверить второе предпо­ложение, была выделена очищенная активная форма трансдуцина — ком­плекс его с GTP. Здесь нас ожидал сюрприз. В неактивной GDP-форме молекула трансдуцина цельна — все три ее субъединицы на­ходятся вместе. Оказалось, что при переходе в GTP-форму трансдуцин диссоциирует: альфа-субъединица отделя­ется от бета и гамма. А GTP связывается со свободной альфа-субъединицей.

Теперь можно было поставить во­прос более точно, чем прежде: выяс­нить, какая субъединица трансдуци­на — альфа (с присоединенным GTP) или бета, -гамма стимулирует действие фосфодиэстеразы. Учёным удалось получить одно­значный ответ. Фосфодиэстеразу ак­тивирует альфа-субъединица (в комплек­се с GTP); остающиеся вместе бета и гамма не влияют на фермент. Более того, альфа-субъединица вызывала актива­цию и без родопсина; это оправдыва­ло предположение о том, что транс­дуцин может активировать фосфодиэстеразу без присутствия родопсина.


альфа-СУБЪЕДИНИЦА ТРАНСДУЦИНА служит переносчиком информации при ак­тивации фосфодиэстеразы.Молекула трансдуцина состоит из трех субъеди­ниц, обозначаемых альфа, бета и гамма. Здесь показаны результаты гель-фильтрации транс­дуцина. Раствор белка пропускал и через колонку, заполненную гелем, собирали равные порции (фракции) вытекающей жидкости и определяли в каждой фрак­ции содержание белка (вверху), связывание аналога GTPGppNHp (в середине) и способность активировать фосфодиэстеразу (внизу). Видно, что трансдуцин в растворе существует в виде двух компонентов различного размера: более мел­кий компонент — это альфа-субъединица, крупный — объединенные бета и гамма. Связы­вание GppNHp и активация фосфодиэстеразы сопутствуют альфа-субъединице.



Каков механизм активации специфической фосфодиэстеразы трансдуцином? В темноте фосфодиэстераза мало активна, так как является объектом тормозного влияния. До­бавление небольшого количества трипсина (фермента, расщепляющего белки) снимает тормозное влияние и фосфодиэстераза активируется. Было известно, что молекула фосфодиэстеразы состоит из трех полипептидных цепей; как и у трансдуцина, они обо­значаются альфа, бета и гамма. Трипсин разрушает гамму-субъединицу, но не альфа и бета-субъединицу. Таким образом, ингибитором фосфодиэстеразы является гамма-субъеди-ница.

Позже учёные выделили гамма-субъединицу в чистом виде, добавили ее к активному ком­плексу альфа-бета и обнаружили, что гамма-субъединица подавляет каталитическую активность более чем на 99%. Кроме того, скорость разрушения гамма-субъединицы трипсином хорошо со­ответствует скорости активации фос­фодиэстеразы в каскаде возбуждения. Трансдуцин в GTP-форме может связываться с гамма-субъединицей фосфодиэстеразы, об­разуя комплекс.

Все эти данные складываются в сле­дующую картину. После воздействия света альфа-субъединица трансдуцина с присоединенным GTP связывается с фосфодиэстеразой и ингибируюшая ее -гамма-субъединица отделяется. В результате проявляется каталитическая активность фосфодиэстеразы. Эта ак­тивность велика: каждая активиро­ванная молекула фермента может осуществить гидролиз 4200 молекул циклического гуанозинмонофосфата за 1 секунду.

Итак, стала ясной большая часть каскада возбуждения. Начальный шаг — это активация трансдуцина родопсином, возбужденным в результа­те поглощения кванта света. Родоп­син вызывает освобождение из трансдуцина GDP. Освободившееся место занимает GTP, альфа-субъединица отде­ляется от остальной части белка, оставляя на себе GTP. Этот процесс длится всего лишь около миллисекун­ды


КАСКАД ВОЗБУЖДЕНИЯ начинается с поглощения фото­на родопсином (вверху слева). Активированный родопсин (родопсин*) взаимодействует (вверху справа) с трансдуцином (Т), что приводит к обмену GDP на GТР, происходящему на а-субъединице трансдуцина. В результате аkmaf-субъединица отделяется от остальной (бета-гамма) части фермента (внизу справа). Трансдуцин снимает торможение с неактивной фосфодиэстеразы (РDЕ), по-видимому, удаляя ее гамма-субъединицу. Активированная фосфодиэстераза рас­щепляет множество молекул сGМР(внизу слева). Через не­которое время «встроенный таймер» альфа-субъединицы транс-дуцина расщепляет GTP с образованием GDP и альфа-субъединица воссоединяется с частицей бета-гамма. Фосфодиэстераза также восстанавливается. В то же время родопсин инактивируется и затем переходит в форму, готовую к активации.


В результате действия одной молекулы родопсина образуется несколько сотен активных комплексов альфа-субъединицы трансдуцина GTP, что является первой ступенью усиления. Затем альфа-субъединица трансдуцина, несущая GTP, активирует фосфодиэстеразу. На этой стадии усиления нет; каждая молекула альфасубъединицы трансдуцина связывает и соответственно активирует одну молекулу фос­фодиэстеразы. Следующую стадию усиления обеспечивает пара трансдуцин—фосфодиэстераза, действующая как одно целое. альфа-Субъединица транс­дуцина остается связанной с фосфоди-эстеразой до тех пор, пока та не рас­щепит 3'-5'-связь в циклическом гуанозинмонофосфате. Каждая активированная молеку­ла фермента может осуществить превращение нескольких тысяч молекул GMP. Это усиление и усиление, обеспечиваемое родопсином, лежат в основе замечательного по своей эффективности преобразования, благо­даря которому один единственный фотон вызывает вполне ощутимый нервный импульс.

Однако организм способен воспринимать свет многократно, значит, этот цикл должен и выклю­чаться. Трансдуцин играет ключевую роль не только в активации, но и в де­активации. Его альфа-субъединица имеет, так сказать, встроенный таймер, ко­торый прерывает активированное со­стояние, превращая связанный GTP в GDP. Механизм действия этого тай­мера не совсем ясен. Известно, что гидролиз GTP с образованием GDP в фазе деактивации играет важную роль в осуществлении всего цикла. Ре­акции, ведущие к активации, энерге­тически выгодны. Напротив, некоторые реакции деактивации невыгодны; без превращения GTP в GDP система не может быть приведена в исходное состояние для новой активации.

Когда GTP расщепляется и образуется GDP, альфа-субъединица трансдуци­на освобождает ингибирующую гамма-субъединицу фосфодиэстеразы. По­том гамма-субъединица опять связывается с фосфодиэстеразой, возвращая ее в состояние покоя. Трансдуцин восстанавливает свою доактивационную форму благодаря воссоединению субъединиц альфа и бета-гамма. Родопсин деактивируется с помощью фермента—киназы, распознающей его специфиче­скую структуру. Этот фермент присоединяет фосфатные группы к несколь­ким аминокислотам на одном конце полипептидной цепи опсина. Родопсин затем образует комплекс с белком, называемым арестином, который блокирует связыва­ние трансдуцина и возврашает систе­му назад в темновое состояние.

Исследования зрительного каскада в конце 1970-х и в начале 1980-х опирались в значительной мере на предпо­ложение о том, что циклический гуанозинмонофосфат открывает натрие­вые каналы в наружной мембране па­лочки и что его гидролиз приводит к их закрыванию. Однако о механизмах этих процессов было мало что извест­но. Действует ли cGMP на каналы прямо или же через какие-то проме­жуточные стадии? Определенный ответ на этот вопрос был получен в 1985 г. нашим соотечественником Е.Е. Фесенко с коллегами из Института биоло­гической физики в Москве.

В опытах этих исследователей использовалась микропипетка, в кото­рую затягивался маленький участок плазматической мембраны палочки. Он плотно прилипал к кончику пипет­ки и та сторона, которая в норме бы­ла обращена внутрь клетки, оказыва­лась наружной. Эту сторону мембраны омывали различными растворами и определяли их влияние на натрие­вую проводимость. Результаты были получены совершенно однозначные: каналы открываются непосредствен­но cGMP; другие вещества, включая ионы кальция, на них не влияют.

Блестящие эксперименты наших отечественных учёных нанесли последний удар по представлениям об ионах кальция как о медиа­торе возбуждения и установили по­следнее звено в каскаде возбуждения. Окончательно обрисовался общий контур цепи возбуждения. Как и предполагалось, поток информации на­правлен от родопсина к трансдуцину, затем к фосфодиэстеразе и, наконец, к cGMP.

Хотя выяснение путей и механиз­мов каскада возбуждения прине­сло глубокое удовлетворение, ряд важных вопросов все еще остается без ответа. В частности, неясно, каким образом регулируется усилительный ответ каскада. Как говорилось выше, палочки значительно менее чувствительны на ярком свету, чем в темно­те. Фоновое освещение должно как-то влиять на общий результат дейст­вия системы, т. е. на суммарное уси­ление, создаваемое на двух стадиях — при передаче сигнала от родопсина к трансдуцину и от фосфодиэстеразы к cGMP. Многое свидетельствует об участии ионов кальция в этом процессе, однако детали пока неизвестны.

Важно было также установить структуру натриевых каналов и механизмы, предотвращающие истоще­ние циклического гуанозинмонофос-фата в клетке. Большой вклад в изуче­ние первой проблемы внесли группы Б. Кауппа из института нейробиоло-гии при Оснабрюкском университете (ФРГ) и Либмана: они выделили управляемые cGMP каналы и рекон­струировали их функцию на модель­ных мембранах. Во второй проблеме ключевой элемент — это, вероятно, гуанилатциклаза — фермент, синтезирующий cGMP. Ясно, что должна существовать петля обратной связи, обеспечивающая после ответа на све­товой стимул восстановление концентрации cGMP до исходного уров­ня; не будь этого, клетка имела бы возможность сработать лишь несколько раз и тем надолго исчерпала бы способность к ответу. Природа такой петли, однако, остается неиз­вестной.

Результаты последних исследований, прояснившие вопросы, касающи­еся зрительного каскада в палочках, имеют отношение и к иным типам клеток. Система преобразования светового сигнала в других фоторецепторных клетках — колбоч­ках — сходна с таковой палочек. Дав­но известно, что в колбочках содер­жатся три аналогичных родопсину зрительных пигмента, отвечающих на свет определенной длины волны — красный, зеленый либо синий. В состав всех трех пигментов входит 11-цис-ретиналь. С применением методов молекулярной генетики было установлено, что структура у колбочковых пигментов такая же, как у ро­допсина. Трансдуцин, фосфодиэстераза и каналы, контролируемые cGMP, в колбочках и в палочках очень похожи. Вероятно, не за горами то время, когда цикл преобразования и передачи сигнала в колбочках будет разработан столь же детально, как и для палочек.

Значение каскада с участием циклического гуанозинмонофосфата не ограничивается зрением. Каскад воз­буждения в палочках имеет заметное сходство с механизмом действия не­которых гормонов. Например, дейст­вие адреналина начинается с того, что он активирует фермент, называемый аденилатциклазой. Аденилатциклаза катализирует образование цикличе­ского аденозинмонофосфата (сАМР), который служит внутриклеточным посредником для многих гормонов. Учёные обнаружили поразительный параллелизм с функционированием каскада возбуждения в палочках. Подобно тому как каскад возбуждения начинается с поглоще­ния фотона родопсином, гормональ­ный каскад начинается со связывания гормона специфическим рецептором, расположенным на поверхности клет­ки. Комплекс рецептор-гормон взаи­модействует с так называемым G-белком, напоминающим трансдуцин. Такой же обмен связанных молекул, какой активирует трансдуцин (GTP на GDP), активирует и G-белок, когда он взаимодействует с комплексом рецептор-гормон. G-белок, как и трансдуцин, состоит из трех субъеди­ниц. Аденилатциклаза активируется его альфа-субъединицей, снимающей тор­мозное влияние. Стимулирующее действие G-белка тоже прекращается благодаря встроенному таймеру, превращающему GTP в GDP.

Сходство трансдуцина и G-белков касается не только активности, но и структу­ры. Трансдуцин и G-белки принадле­жат к одному семейству — семейству белков, передающих те или иные сиг­налы. Все идентифицированные к на­стоящему времени представители этой группы имеют практически оди­наковую альфа-субъединицу. Кроме того, альфа-субъединица выполняет одну и ту же функцию, что показано сейчас на молекулярном уровне. Недавно в нескольких лабораториях установили нуклеотидные последовательности ДНК, кодирующих а-субъединицы трансдуцина и трех G-белков. Судя по ДНК, аминокислотные последовательности этих четырех полипептид­ных цепей примерно на половине сво­ей длины идентичны или почти иден­тичны.

При сравнительном анализе генетической информации обнаружилось, что в составе альфа-субъединиц трансдуцина и G-белков имеются как участки, оставшиеся неизменными в ходе эво­люции, так и сильно дивергировавшие области. В каждом белке имеют­ся три места связывания: одно для гуаниловых нуклеотидов, одно для активированного рецептора (родопсина или комплекса гормон—рецептор) и одно для эффекторного белка (фосфодиэстеразы или аденилатциклазы). Места связывания GTP и GDP, как и следовало ожидать, исходя из их решающей роли в каскаде возбуждения, оказались наиболее консерватив­ными.

Кроме того, оказалось, что GTP-связывающие участки этих белков напоминают одну область функцио­нально совершенно иного белка, а именно так называемого фактора элонгации Tu. Этот белок играет важную роль в синтезе белков: он образу­ет комплекс с GTP и с молекулами аминоацил-тРНК, а затем связывается с рибосомой, т. е. обеспечивает до­ставку аминокислот к месту удлине­ния синтезируемой полипептидной цепи. Цикл событий, происходящих с белком Tu в процессе его функциони­рования подобен трансдуциновому циклу. Цикл начинается расщеплени­ем GTP. На молекуле Тu есть место связывания GTP, причем по аминокислотной последовательности оно очень сходно с участками связывания гуаниловых нуклеотидов в трансду-цине и различных G-белках.

Синтез белков — один из основных аспектов метаболизма клетки, и вероятно, что фактор элонгации Тu, участвующий в этом фундаментальном процессе, в ходе эволюции возник раньше, чем G-белки или родствен­ный им трансдуцин. Тu мог бы быть предком и трансдуцина, и G-белков. Контролируемое высво­бождение и связывание белков, сопряженное с обменом GTP на GDP, несомненно, сформировалось на ран­них этапах эволюции; фактор элонга­ции Тu, возможно, представляет один из первых вариантов такого цикла.

Одна из удивительных особенностей эволюции заключается в том, что механизм, возникший примени­тельно к определенной функции, мо­жет в дальнейшем изменяться и использоваться для совершенно иных функций. Именно это, и произошло с механизмом действия Тu. Сформировавшись в ходе эволюции для осуществления синтеза белка, он сохранялся на протяжении миллиар­дов лет и в конце концов вошел в си­стему передачи гормональных и сен­сорных стимулов. В последние не­сколько лет одна из его функций — трансдуциновыи цикл — выяснена до мельчайших деталей. Результаты этих исследований вызывают глубокое удовлетворение. Впервые удалось на молекулярном уровне понять один из наиболее прецизионных сенсорных механизмов — механизм зрительного возбуждения.

HEAVY WATER AND LIFE
ON THE ROLE OF DEUTERIUM IN MOLECULAR EVOLUTION

 

Oleg V. Mosin1

 

1 Department of Biotechnology, M. V. Lomonosov State Academy of Fine Chemical Technology, Vernadskogo Prospekt 86, 117571, Moscow, Russia

 

SUMMARY

The role of deuterium in molecular evolution is most interesting question of nowdays science comprises two points mainly: the evolution of deuterium itself as well as the chemical processes going with participation of deuterium. It is believed the big bang produce the universe that was much denser and hotter than it is now and made almost entirely of two main elements - hydrogen and helium. Deuterium itself was made only at a second stage of the beginning of the universe, namely through the collision of one neutron with one proton at a temperature of about one billion degrees; furthemore the two formed deuterons in turn stuck together into helium nuclei, which contain two protons and two neutrons. It is considered, that during the formation of helium nuclei, almost all the deuterons combined to form helium nuclei, leaving a tiny remant to be detected today so that only one in 10.000 deuterons remained unpaired. Thus, deuterium serves as a particularly important marker. The quantity of deuterium in contemporary nature is approximately small and measured as no more than 0.015% (from the whole number of hydrogen atoms) and depends strongly on both the uniformity of substance and the total amount of matter formed in course of early evolution. One may suggest, that the very reliable source of producing of deuterium theoretically may to be the numerical explosions of nova stars, but deuterium itself is very readily destroyed in those stars. If it was so, perhaps this was the answer to the question why the quantity of deuterium increased slitely during the global changes of climate for worming conditions. The second point is the chemical processing of deuterium as a result of this the 2H2O on the first hand may be formed from gaseous deuterium and atomic oxyden at very high temperature. Pretty interesting with chemical point of view seems our own idea proposed recently about the possible small enrichment of primodial environment with 2H2O. We supposed, that this fact if really existed, may be conditioned by a powerful electrical discharges taken place in premodial atmosphere laking the natural shield of ozone and may be resulting in electrolysis processes of H2O, e.g. those ones are now used for the enrichment of 2H2O. But the realization of this process with practical point of view seems unlikely.  Nevertheless, if such process has really occured, the some hydrophobic effects of 2H2O as well as chemical isotopic effects should be taken into account while discussing the chemico-physical properties of primodial environment. Perhaps, it is also a big practical interest to study the properties of fully deuterated membraine structures composed for example from fully deuterated lipids and proteins. Either way or not, the model of deuterium evolution provides a framework for predicting the biochemical consequences of such new fascinating ideas.

SUMMARY:

Deuterium (2H), the hydrogen isotope with nuclear mass 2, was discovered by Urey. In the years immediately following this discovery, there developed a keen interest in development of methods for uniform biological enrichment of a cell with 2H, that may be best achived via growing of an organism on medium with high content of 2H2O (99% 2H), which since yet resulted in a miscellany of rather confusing data (see as an example Katz J., Crespy H. L. 1972).

The main resolute conclusion that can be derived from the most competent and comprehensive of the early studies is that high concentrationsof 2H2O are incompatible with life and reproduction and furthemore could even causing even lethal effects on a cell. However, today a many cells could be adapted to 2H2O either via employing a special methods of adaptation which of them we shall describe above, or using selected (or/and resistent to 2H2O) strains of bacterial and other origin.

In this connection the main interesting question arises-what is the nature of this interesting phenomenon of biological adaptation to 2H2O and what is the role of life important macromolecules (particularly DNA, individual proteins, and/or enzymes) in this process? It is seems very likely, that during adaptation to 2H2O the structure and conformation of [U -2H]labeled macromolecules undergoing some modifications that are more useful for the working in 2H2O-conditions. Unfortunately, there are a small number of experiments carried out with fully deuterated cells, that could confirmed that during the growth on 2H2O [U-2H]labeled macromolecules with difined isotopical structures and conformations are formed, so that a discussion about the role of deuterium on the structure and the conformation of [U-2H]labeled macromolecules in course of biolodical adaptation to 2H2O is still actual through more than four decades of years after the first description of the biological consequences of hydrogen replacement by deuterium.

To further discuss the matter, we should distingueshed mainly three aspects of biological enrichment with deuterium: chemical, biological and biophysical aspects, all of them are connected in some way with the structure of [U -2H]labeled macromolecules. Theoretically, the presence of deuterium in biological systems certainly could be manifested in more or less degree by changes in the structure and the conformation of macromolecules. Nevertheless, it is important namely what precise position in macromolecule deuterium ocupied and dipending from that the primary and secondary isotopic effects are distingueshied. For example, most important for the structure of macromolecule the hydrogen (deuterium) bonds form between different parts of the macromolecule and play a major part in determining the structure of macromolecular chains and how these structures interact with the others and also with 2H2O environment. Another important weak force is created by the three-dimentional structure of water (2H2O), which tends to force hydrophobic groups of macromolecule together in order to minimize their disruptive effect on the hydrogen (deuterium)-bonded network of water (2H2O) molecules.

On the other side the screw parameters of the proton helix are changed by the presence of deuterium so that ordinary proteins dissolved in 2H2O exhibit a more stable helical structure (Tomita K., Rich A., et all., 1962). While 2H2O probably exerts a stabilizing effect upon the three-dimentional hydrogen (deuterium)-bonded helix via forming many permanent and easily exchangeable hydrogen (deuterium) bonds in macromolecule in the presence of 2H2O (as an example the following types of bonds -COO2H; -O2H; -S2H; -N2H; N2H2 et.), the presence of nonexchangeable deuterium atoms in amino acid side chains could only be synthesized de novo as the species with only covalent bonds -C2H, causes a decrease in protein stability.

These opposing effects do not cancel with the case of protein macromolecule, and fully deuteration of a protein often results in the destabilization. As for the deuteration of DNA macromolecule, today there are not reasonable considerations that such negative effect of 2H2O on the structure and function is really existiting. Nevertheless, deuterium substitution can thus be expected to modify by changes in the structure and the conformation of both [U- 2H]labeled DNA and protein, not only the reproductionl and division systems of a cell, and cytological or even mutagenical alterations of a cell, but to a greater or lesser degree of an order of a cell.

It should be noted, however, that not only these functions but also the lipid composition of cell membrane are drastically changed during deuteration. The lipid composition of deuteriated tissue culture cells has been most complitely investigated by a certain scientists (Rothblat et all., 1963, 1964). As it is reported in these articles mammalian cells grown in 30% (v/v) 2H2O contain more lipid than do control cells. THe increase in the lipids of 2H2O grown cells is due primarily to increased amounts of triglycerids and sterol esters. Radioisotope experiments indicate that the differens are due to an enhanced synthesis of lipid. Monkey kidney cells grown in 25% (v/v) 2H2O and or irradiated with X-rays likewise showed increases of lipid. The 2H2O grown cells contained more squalene, sterol esters, sterols, and neutral fat than did either the control of X-irradiated cells. Phospholipid levels were equal for all groups of cells. Thus the effects of 2H2O on lipid synthesis are qualitatively quite similar to those of radiation damade. An interisting observation that deserves further scrutiny relates to the radiation sensitivity of deuterated cells. Usually, cells grown and irradiated in 2H2O shown much less sensivity to radiation than ordinary cells suspended in water. Suspension of ordinary cells in 2H2O did not have any effect on the reduced sensitivety became apparent.

A serious alteration in cell chemistry must be reflected in the ability of the cells to divide in the presence of 2H2O and in the manner of its division. However, a many statements suggesting that 2H2O has a specific action on cell division are common since today. Probably it may be true that rapidly proliferating cells are highly sensitive to 2H2O, but that deuterium acts only to prevent cell division is unlikely.

The rabbit cells grown on medium containing the various concentrations of 2H2O shown, that 2H2O caused a reduction in cell division rate, and this effect increased as the concentration of 2H2O or duration of exposure, or both, were increased (Lavillaureix et all., 1962). With increasing concentration of 2H2O the frequency of early metaphases increased, accompanied by proportional decreases in the other phases.

It was suggested that 2H2O blocks mitosis in the prophase and the early metaphase of many cells grown in 2H2O. The blockage, however, was overcome if the initial concentration of 2H2O was not too high and the exposure time not too long. In experiments with eggs of the fresh water cichlid fish Aequidens portalegrensis, they observed that in 30% 2H2O only one-fifth of the eggs hathed and in 50% (v/v) 2H2O none did so. Segmentation in fertilized frog eggs developed normally for 24 hours in 40% (v/v) 2H2O, after which the embryos died. It was also found by Tumanyan and Shnol that 2H2O disturbed embryogenesis in Drosophila melanogaster eggs (Lavillaureix et all., 1962. Feeding female flies with 20% (v/v) 2H2O caused a significant increase in the proportion of nondeveloped eggs, whether males were deuterated or not.

As pointed out by many researches, carried elsewhere, the reason for the cessation of mitotic activity from exposure to 2H2O is not clear. Certain microorganisms have been adapted to grow on fully deuterated media. However, higher plants and animals resist adaptation to 2H2O. Even in microorganisms, however, cell division appears initially to be strongly inhibited upon transfer to highly deuterated media.

 

After the adaptation, however, cellular proliferation proceeds more or less normally in 2H2O, but this stage is not reached in higher organisms. No ready explanation in terms of the present understanding of mitosis suggests itself. In Arbacia eggs antimitotic action of 2H2O is manifested almost immediately at all stages of the mitotic cycle and during cytokinesis (Gross P. R., et all., 1963, 1964).

 

Table. Isotope components of growth media and characteristics of bacterial growth of Brevibacterium methylicum

 


Media components, % (v/v)

H2O 2H2O MetOH [U -2H]

MetOH

Lag-phase (h)

Yield of

biomass (%)

Generation time (h)

Production of phenylalanine (%)

(a)

98

0

2

0

20

100.0

2.2

100.0

(b)

73.5

24.5

0

2

34

85.9

2.6

97.1

(c)

49.0

49.0

0

2

44

60.5

3.2

98.8

(d)

24.5

73.5

0

2

49

47.2

3.8

87.6

(e)

0

98.0

0

2

60

30.1

4.9

37.0

 

A stabilizing action on the nuclear membrane and gel structures, i.e., aster, spindle, and peripheral plasmagel layer of the cytoplasm, can be detected. Prophase and metaphase cells in 80% (v/v) 2H2O remain frozen in the initial state for at least 30 minutes. Furrowing capacity probably is not abolished by 2H2O. The 2H2O-block is released on immersion in 2H2O although cells kept in deuterium-rich media for long periods show multipolar and irregular divisions after removal to 2H2O, and may subsequently cytolyze. The inhibition of mitosis in the fertilized egg is not the only interesting effect of deuterium. The unfertilized egg also responds. It was described by Gross that deuterium parthenogenesis in Arbacia in the following graphic terms: if an unfertilized egg is placed in 2H2O, there appear in the cytoplasm, after half an hour, a number of cytasters. The number then increases with time. If, after an hours immersion in 2H2O, eggs are transferred to normal sea water, a high proportion (80% of the population) raises a fertilization membrane, which gives evidence that activation has occurred.

Deuterium genetics is, for the most part, like genetics itself, conveniently divisible into dipteran mutation studies, the genetics of microorganisms, and miscellaneous studies of which those of Gross and Harding, and Flaumenhaft et al. are examples. The customary procedure in most of the dipteran and bacterial investigations so far reported has been to administer 2H2O to the organism and then to test it for mutation or other chromosomal change. The results obtained by such an investigation have seldom been striking. For example, many researchers found an increase in sex-linked lethals in the sperm of flies that had been exposed to deuterium, either by way of injection into their pupae, or by the inclusion of 2H2O in their food. They introduced 2H2O into Drosophila melanogaster larvae both by feeding and by injection. The males which matured from these larvae were tested for mutation by CIB method. But the test showed no increase in the mutation rate. It was assumed by these scientists that the deuterium which was used in dilute form entered the DNA molecule.

De Giovanni and Zamenhof have carried out the most comprehensive investigations on the genetic effects of deuterium in bacteria. The results are of considerable interest. For example, they found a several mutants of E. coli, including a so called rough mutant 1/D which is more resistant to 2H2O than its parent strain, were isolated from E. coli grown in 2H2O media. The spontaneous frequency of occurerence of this mutant was 10-4, and the mutation rate could be increased 300-fold by ultraviolet irradiation. This mutant was derived only from the strain E. coli 15 thymidine, and no similar mutant was observed in other strains of E. coli or B. subtilis. By application of a fluctuation test, De Giovanni then was able to show convincingly that this mutation to increased deuterium resistance occurred spontaneously and not in response to the mutagenic effect of 2H2O. Back mutations in some instances do seem to occur at higher rates in 2H2O. Reversion from streptomycin dependence to streptomycin sensitivity in E. coli strain Sd/4, or from thymine dependence to thymine independence in strain 1 occurs with higher frequency in 2H2O, but 2H2O does not cause a discernible increase in mutation in the wild type.

De Giovanni further found that deuteriated purines and pryrimidines had no effect upon the growth and back mutation rates of specific base-requiring strains. Thymine containing deuterium in two of the four nonexchangeable positions adequately supplied the requirement for thymine with no concominant genetic changes. It would appear therefore that the preponderance of the evidence from these studies with bacteria is in favor of the view that 2H2O is not a strong mutagenic agent.

It was reported by many researchers a series experiments designed to test the ability of deuterium to produce mutation and nondisjunction. Deuterium like tritium appear to increase nondisjunction, but either agent separately is less effective than the two acting together. Hughes and Hildreth exposed male flies which had been grown on a 20% (v/v) 2H2O diet to an irradiation of 1000 r. of X-rays. It was found that there was not significant difference in the frequency of observed mutations between 2H2O flies and normal flies subjected to the same radiation.

Tumanyan and Shnol also found no mutagenic effect of 2H2O on recessive and dominant lethal marks in D. melanogaster, inbred line Domodedovo 18. Flaumenhaft and Katz grew fully deuteriated E. coli in 99,6% (v/v) 2H2O with fully deuteriated substrates, and found that the mutation rate after ultraviolet irradiation was distinctly lower than that of nondeuteriated organisms. The simultaneous presence of both deuterium and protium in nearly equal proportions in the constituent molecule of an organism could conceivably create difficulties for the organism since the rate pattern would be seriously distorted. They further found that cells grown in 2H2O and then transferred to 2H2O showed an enhanced susceptibility to ultraviolet irradiation. This suggests that organisms containing both hydrogen or deuterium, but it leaves unanswered the question of why serial subculture in H2O-2H2O media is required for adaptation of many organisms.

Many researchers studied the growth of phage T4 in E. coli cells which were cultivated in media containing various concentrations of 2H2O from zero to 95% (v/v). No significant increase in forward mutation in this phage could be observed, but the rate for reverse mutation was increased, and reached a maximum in phage grown in 50% (v/v) 2H2O. Although it was reported that a further increase in H2O concentration up to 90% (v/v) producers little augmentation of the reversion index, the actual data presented by Konrad indicates a decided increase in reverse mutation rate in phage exposed to more than 50% (v/v) 2H2O.

There have been carried out a big deal of cytochemical study of fully deuteriated microorganisms grown autotrophically for very long periods in 2H2O (Flaumenhaft E., Conrad S. M., and Katz J. J., 1960a, 1960b). The main conclusion that could be made from these studies is that the nucleus of deuterated cells was much larger than that of nondeuterated cells, and it contained greater amounts of DNA. Also present were much greater amounts of rather widely scattered cytoplasmic RNA within the cells. It was found also, that deuterated cells stained much more darkly for proteins, indicating higher concentrations of free basic groups. Both fluorescence and electron microscopy indicated that deuteration results in readily observable morphological changes. For example, the chloroplast structure of deuteriated plants organisms was more primitive in appearance, less well-differentiated, and distinctly less well-organized. The very interesting conclusion was made, then a low or/and high temperature grown organisms implied the morphological consequences of extensive isotopic replacement of hydrogen by deuterium so that in some respects resemble with the effects produced by reduction or/and increase in temperature of growth.

But, paradoxically as shown numerious studies on biological adaptation to 2H2O, a many cells of bacterial and algae origin could, nevertheless, well grown on absolute 2H2O and, therefore, to stabilize their biological apparatus and the structure of macromolecules for working in the presence of 2H2O. The mechanism of this stabilization nor at a level of the structure of [U-2H]labeled macromolecules or at a level of their functional properties is not yet complitely understood. We still don’t know what possibilities a cell used for adaptation to 2H2O. We can only say, that probably, it a complex phenomenon resulting both from the changes in structural and the physiological level of a macrosystem. That is why there is every prospect that continued investigation of deuterium isotope effects in living organisms will yield results of both scientific and practical importance, for it is precisely. For example, the studies of the structure and the functioning of biolodical important [U -2H]labeled macromolecules obtained via biological adaptaition to high concentrations of 2H2O are most attract an attention of medical scientists as a simple way for creating a fully deuterated forms of DNA and special enzymes could well be working in a certain biotechnological processes required the presence of 2H2O. Secondly, if the structure of fully deuterated proteins may be stabilized in 2H2O in a view of duarability of deuterated bonds, it would be very interesting to study the thermo-stability of [U -2H]labeled proteins for using them directly in processes going at high temperatures.

It would be very perspective if someone could create the thermo-stable proteins simply via deuteration of the macromolecules by growing a cell-producent on 2H2O wit 99% 2H. Third, particular interest have also the studies on the role of primodial deuterium in molecular evolution. The solution of these obscure questions concerning the biological adaptation to 2H2O should cast a new light on molecular evolution in a view of the preferable selection of macromolecules with difined deuterated structures. Thus, the main purpose of the present project is the studies of the structure and the function of fully deuterated macromolecules (particularly DNA and individual proteins and/or enzymes) obtained via biological adaptation to high concentrations of 2H2O.

To carry out the studies with fully deuterated macromolecules one must firstly to obtain the appropriate deuterated material with high level of enrichment for isolation of pure DNA and individual proteins to whom the various methods of stable isotope detection further can be applyed. For example, the three-dimentional NMR combined together with the method of X-ray diffraction, infrared (IR)-, laser spectrometry and circular dichroism (CD) is a well proved method for the studies of the structure and the functioning of [U -2H]labeled macromolecules, and for investigations of various aspects of their biophysical behavior. Taking into account the ecological aspect of using [U -2H]labeled compounds, it should be noted in conclusion, that the preferable properties of applying deuterium for biochemical studies are caused mainly by the absence of radioactivity of deuterium that is the most important fact for carrying out the biological incorporation of deuterium into organism.

 

SCIENTIFIC ACTUALITY OF THE RESEARCH

A special attention is to be given to the investigation of biological adaptation to 2H2O allowing cells to synthesize a deuterated forms of macromolecules (particulary interest have DNA and short-chain individual proteins both with well known amino acid sequence and conformation) with a certain structure allowing their functioning in 2H2O environment.

Firstly, in this connection it would be very interesting to know, how the structure of fully deuterated macromolecules could be changed neganively or positively in a course of biological adaptation to 2H2O requiring the presence of high concentrations of 2H2O in growth media.

Secondly, if a cell will be growing on media containing the stepwise increasing concentrations of 2H2O, for example starting up from zero up to 100% (v/v) 2H2O, will the changes in the structure of [U -2H]labeled macromolecules to be corresponding to the 2H2O content in media and what is a limit concentration of 2H2O when the macromolecular structure keeps a stable constancy and how this fact corresponds with a limit of biological resistance to 2H2O? For answers to these questions a number of modern consideration at the levels of the structure (primary, secondary, tertiary) and conformation of [U -2H]labeled DNA and individual proteins with using the methods of a special sequencing and modifications of deuterated macromolecules combined together with gel electrophoresis method as well as such powerful methods as NMR-spectroscopy to which will be taken a most part of proposed research, X-ray diffraction, IR-, laser- and CD-spectroscopy will be further involved.

An investigation will necessary mainly into the structure of [U -2H]labeled macromolecules in order to find at what level of macromolecular hierarchy a substitution of hydrogen atoms with deuterium ensued the consequence on the differences in the structure and the conformation of macromolecules and, therefore, the functional properties of the macromolecules in 2H2O. In the frames of proposed research the developing of methods of biological adaptation to obtain [U -2H]labeled biological material with high levels of enrichment are also of a big interest. For this purpose the special biotechnological approaches based on using the strains with improved properties when growing on 2H2O for obtaining fully deuterated DNA and individual proteins should be applied for allowing to prepare [U -2H]labeled macromolecules in gram scale quantities.

 

DISCUSSION

1. The methods for analyzing the structure and the conformation of [U -2H]labeled macromolecules.

The biological labelling with deuterium is an useful tool for investigating the structure and the conformational properties of macromolecules. The fundamental objectives have meant that living models have retained their importance for functional studies of such biological important macromolecules and can be used to obtain structural and dynamic information about the [U -2H]labeled macromolecules.

The method of X-ray diffraction should be noted as a indespencible tool for determing the details of the three-dimentional structure of globular proteins and other macromolecules (Mathews C. K., van Holde K. E., 1996). Yet this technique has the fundamental limitation that it can be employed only when the molecules are crystallized, and crystallization is not always easy or even possible. Furthermore, this method cannot easily be used to study the conformational changes in response to changes in the molecules environment.

Other methods, for example IR-spectroscopy, can provide direct information concerning the macromolecular structure. For example, the exact positions of infrared bands corresponding to vibrations in the polypeptide backbone are sensitive to the conformational state ( helix,  sheet et.) of the chain (Campbell I. D., and Dwek R. A., 1984). Thus, the studies in this region of the spectrum are often used to investigate the conformations of protein molecules.

Although, IR-, and absorption spectroscopy can be helpful in following molecular changes, such measurements are difficult to interpret directly in terms of changes of secondary structure. For this purpose, techniques of circular dichroism involving polarized light have become important (Johnson W. C., 1990). For example, if a protein is denatured so that its native structure, containing  helix and  sheet regions, is transformed into an unfolded, random-coil structure, this transformation will be reflected in a dramatic change in its CD spectrum. Circular dichroism can be used in another way, to estimate the content of  helix and  sheet in native proteins. The contributions of these different secondary structures to their circular dichroism at different wavelenghths are known, so we may attempt to match an observed spectrum of protein by a combination of such contributions.

Although circular dichroism is an extremely useful technique, it is not a very discriminating one. That is, it cannot, at present, tell us what is happening at a particular point in a protein molecule. A method that has the great potential to do so is nuclear magnetic resonance. This advance now make it possible to use NMR to study a big varieties of DNA and proteins with more complex biological functions functioning in natural liquid environment. Often these proteins have more than one domain and more than one site of interaction. Allosteric systems, receptors and small molecule ligand-modulated DNA-binding proteins and DNA are some examples of the molecular systems which can now be analysed in molecular detail. For example, due to the development of two-dimentional Fourier transformation techniques, NMR spectroscopy has become a powerful tool for determining the protein structure and conformation (Fesic S. W. and Zuiderweg E. R., 1990).

 

2. The preparation of [U- 2H]labeled macromolecules.

Through technical advances of biotechnology, many macromolecules, for example a certain individual proteins are successfuly cloned and can be obtained in large quantities by expression in microbial and/or mammalian systems, so that an ever-increasing number of individual [U- 2H]labeled macromolecules from various biological objects are becoming commercially available. It should be noted, however, that the application of various methods for the preparation of [U -2H]labeled macromolecules (chemical or biosynthetical) often results in obtaining the forms of molecules with different number of protons substituted by deuterium, the phenomenon that is known as heterogenious labelling, so that the special methods for the preparation of [U -2H]labeled macromolecules should be applyed to minimaze this process. For example, the proteins containing only deuterium atoms in polypeptide chain of macromolecule can be produced biotechnologically with using the special genetically constructed strains of bacteria carrying the mutations of geens excluding the metabolic exchange between the parterns of unlabeled intermediators during the biosynthesis of [U -2H]labeled macromolecules.

I may briefly indicate three possibilities for deuterium enrichment:

(1) to grow the organism on a minium salt medium with content of 2H2O 99% 2H;

(2) To grow the organism on a medium supplemented with 99% 2H2O and [U -2H]labeled amino acid mixture.

(3) the isotopic exchange of susceptible protons in amino acid residues already incorporated into protein.

Method 1 is very useful for the preparation of [U- 2H]labeled macromolecules if only applyed strains of bacterial or different origin could well be grown on minimal media in the presence of high concentrations of 2H2O. Very often in this case the biological adaptation to 2HO is required. Method 2, while generally applicable, is limited by the difficulty and expense of preparing fully deuterated amino acid mixtures from algae grown on 2H2O. However, recently we proposed to use a fully deuterated biomass of methlotrophic bacterium B. methylicum with protein content about 55% (from dry weight) obtained via multistep adaptaition to 98% (v/v) 2H2O and 2% (v/v) [U-2H]MetOH as growth substrates for growing the other bacterial strains to prepare a gram quantities of [U -2H]labeled amino acids, proteins and nucleosites with high levels of enrichment (90.0-97.5% 2H) (Mosin O. V., Karnaukhova E. N., Pshenichnikova A. B.; 1994; Skladnev D. A., Mosin O. V., et all; 1996; Shvets V. I., Yurkevich A. M., Mosin O. V.; 1995).

Method 2 is also necessary when the organism will not grow on a minimal medium as it was in the case with the applying the bacteria requiring the complex composition media for their growth. This approach will also be necessary for the labeling of proteins expressed in systems other than E. coli (e.g. yeast, insect, and mammalian expression systems) which may be important for the proper folding of proteins from higher organisms. Since the protons of interest in proteins are most often carbon bound and thus do not exchange under mild conditions, method 3 is severely limited by stability of proteins under the harsh conditions necessary for (1H-2H) exchange.

 

4. ADAPTATION TO 2H2O AND BIOPHYSICAL PROPERTIES OF [U -2H]LABELED MACROMOLECULES

 

1. The main hypothese.

We proposed that a cell theoretically could in principle synthezise a big number of forms of [2H]labeled macromolecules with somewhat different structures and conformations, so that a cell could easily select a preferable one from al these species in a course of adaptation to 2H2O, that is the best suitable namely for that conditions. A simple imaginary principle I am going to discuss here perhaps somewhat may explain this probable mechanism. Let us suppose, for example that there are at least two imadinary structural systems - ordinary (normal) system call it a system 1 and unordinary (adaptive) system 2 (see a Figure above). Supporse, that the environment is a homoginious substanse and compose from ordinary substance A (H2O) (situation 1). The necessarely condition for the normal working of this model in natural H2O environment is that system 1 works and system 2 stay in background (situation 2). Supporse, that the environment have changed for substance B (2H2O). Then the system 2 will work, while the system 1 will stay in background (situation 2). When environment will be the natural again, the system 1 will begin the work again, while the system 2 will stay in background. Admitt, that the two systems both presented at the time being and could be regulated in such way that they may switch bitween each other during the working so that the model system does not undergoing the considerable alterations.

 

2. Phenomenon of biological adaptation to 2H2O.

Our research has confirmed, that ability to adaptation to 2Н2О is differed for various species of bacteria and can to be varried even in frames of one taxonomic family (Mosin O. V. et al., 1996a, 1996b).From this, it is possible to conclude, that the adaptation to 2Н2О is determined both by taxonomic specifity of the organism, and peculiarities of the metabolism, as well as by functioning of various ways of accimilation of hydrogen (deuterium) substrates, as well as evolutionary level, which an object itself occupies. The less a level of evolutionary development of an organism, the better it therefore adapts itself to 2H2O. For example, there are halophilic bacteria that are being the most primitive in the evolutionary plan, and therefore, they practically not requiring to carry out a special adaptation methods to grow on 2Н2О. On the contrary, bacills (eubacteria) and methylotrophs (gram-negative bacteria) worse adapted to 2Н2О.

At the same time for all tested cells the growth on 2H2O was accompanied by considerable decrease of a level of biosynthesis of appropriated cellular compounds. The data obtained confirm that the adaptation to 2Н2О is a rather phenotypical phenomenon, as the adapted cells could be returned to a normal growth and biosynthesis in protonated media after lag-phase (Mosin O. V. et al., 1993).

However, when the adaptive process goes continuously during the many generation, the population of cells can use a special genetic mechanisms for the adaptation to 2H2O. For example, mutations of geens can be resulted in amino acid replacements in molecules of proteins, which in turn could cause a formation of a new isoenzymes, and in the special cases - even the anomal working enzymes of a newer structure type. The replacements of these compounds can ensure a development of new ways of regulation of enzymic activity, ensuring more adequate reaction to signals, causing a possible changes in speeds and specifity of metabolic processes.

Despite it, the basic reactions of metabolism of adapted cells probably do not undergo essential changes in 2Н2О. At the same time the effect of convertibility of growth on Н2О/2Н2О - does not theoretically exclude an opportunity that this attribute is stably kept when cells grown on 2Н2О, but masks when transfer the cells on deuterated medium.

However, here it is necessary to emphasize, that for realization of biological adaptation to 2H2O the composition of growth medium plays an important role. In this case it is not excluded, that during the adaptation on the minimal medium, containing 2Н2О there are formed the forms of bacteria, auxotrophic on a certain growth factors (for example amino acids et) and thereof bacterial growth is inhibited while grown on these media. At the same time the adaptation to 2Н2О occurs best on complex media, the composition of which coul compensate the requirement in those growth factors.

It is possible also to assume, that the macromolecules realize the special mechanisms, which promote a stabilization of their structure in 2H2O and the functional reorganization for best working in 2Н2О. Thus, the distinctions in nuclear mass of hydrogen atom and deuterium can indirectly to be a reason of distinctions in synthesis of deuterated forms of DNA and proteins, which can be resulting in the structural distinctions and, hence, to functional changes of [2H]labeled macromolecules. Hawever, it is not excluded, that during incubation on 2Н2О the enzymes do not stop the function, but changes stipulating by isotopic replacement due to the primary and secondary isotopic effects as well as by the action of 2Н2О as solvent (density, viscosity) in comparison with Н2О are resulted in changes of speeds and specifics of metabolic reactions.

In the case with biological adaptation to 2H2O we should inspect the following types of adaptive mechanisms:

1. adaptation at a level of macromolecular components of cells: It is possible to allocate mainly two kinds of such adaptation:

(a). Differences of intracellular concentration of macromolecules;

(b). The forming in 2H2O the deuterated macromolecules with other conformations, which could be replaced the ordinary protonated macromolecules synthesized by cells in normal conditions.

We suppose, that in principle, any protein macromolecule could adopt an almost unlimited number of conformations. Most pilypeptide chains, however, fold into only one particular conformation determined by their amino acid sequence. That is because the side chains of the amino acids associate with one another and with water (2H2O) to form various weak noncovalent bonds. Provided that the appropriate side chains are present at crucial positions in the chain, large forces are developed that make one particular conformation especially stable.

These two strategies of adaptation could possible to be distinqueshed accordinly as "quantitative" and "qualitative" strategies;

2. adaptation at a level of microenvironment in wich macromolecules are submerged: the essence of this mechanism is, that the adaptive change of structural and conformational properties of [2H]labeled macromolecules is conditioned both by directional action of 2H2O environment on a growth of cells and by its physico-chemical structure (osmotic pressure, viscosity, density, рН, concentration of 2H2O).

2H2O appeared to stabilize the plasmagel structure of biological microenvironment. The external pressure required to make the cells assume a spherical shape increased 3.6 kg/cm2 for each per cent increase in the presence of 2H2O. It thus seems well established that deuteration can affect the mechanical properties of cytoplasm, and that this factor must be taken into account in assessing the consequences of isotopic substitution of macromolecules. In model experiments with gelatin structure, it was demonstrated that in 2H2O there is a greater protein-protein interaction than in H2O (Scheraga J. A; 1960).

A progressive increase in the melting temperature of the gel in 2H2O is observed accompanied by an increase in the reduced viscosity. That 2H2O can have marked effects on the physical properties of proteins has been known for some time. Consequently it is natural to attribute changes in the mechanical properties of cell structures induced by 2H2O to protein response. Nevertheless, the effects of deuterium on proteins, while real, must be only a partial explanation of the situation. The interaction of proteins with solvent water is extraordinarily complex, and the exact nature of the protein is crucial in determining the magnitude of changes resulting from the replacement of H2O by 2H2O.

This mechanism has extremely large importance and supplements the macromolecular adaptation; 3. adaptation at a functional level, when the change of an overall performance of macromolecular systems, is not connected with a change of a number of macromolecules being available or with the macromolecules of their types. Adaptation in this case could provide the changes by using the already existing macromolecular systems - according to requirements by this or that metabolic activity.

 

 

TABLE

Some physical constants of ordinary and heavy water

 

Physical constant

 

H2O

2Н2О

Density, d20 (g/c.c)

0,9982

1,1056

Molecular volume, V20 (ml/mole)

18,05

18,12

Viscosity 20 (centipose)

1,005

1,25

Melting point (0C)

0,1

3,82

Boiling point (0C)

100,0

101,72

Temperature of maximum density (0C)

4,0

11,6

Ion product (25 0C)

10-14

0,3x10-14

Heat of formation (cal/mole)

-68,318

-70,414

Free energy of formation (cal/mole)

-56,693

-58,201

Entropy (e.u/mole)

45,14

47,41

 

Secondary effects may still be of importance in biological systems sensitive to kinetic distortions. Deuterium also affects equilibrium constants, particularly the ionization constants of weak acids and bases in composition of macromolecules dissolved in heavy water (see a Table below). Acid strength of macromolecules in 2H2O is decreased by factors of 2 to 5, and consequently, the rates of acid-base catalyzed reactions may be greatly different in 2H2O as compared to H2O. Such reactions frequently may be a faster in 2H2O than H2O solution (Covington A. K., Robinson R. A., and Bates R. G., 1966; Glasoe P. K., and Long F. A., 1960).

 

4. The chemical isotopic effect of 2H2O.

The effect of isotopic replacement that has particularly attracted the attention of chemists is the kinetic isotope effect (Thomson J. F., 1963). The substitution of deuterium for hydrogen in a chemical bond of macromolecules can markedly affect the rate of scission of this bond, and so exert pronounced effects on the relative rates of chemical reactions going in 2H2O with participation of macromolecules. This change in rate of scission of a bond resulting from the substitution of deuterium for hydrogen is a primary isotopic effect. The direction and magnitude of the isotope effect will depend on the kind of transition state involved in the activated reaction complex, but in general, deuterium depresses reaction rates. The usual terminology of the chemist to describe the primary kinetic effect is in terms of the ratio of the specific rate constants kh/kd. The maximum positive primary kinetic isotopic effect which can be expected at ordinary temperatures in a chemical reaction leading to rupture of bonds involving hydrogen can be readily calculated, and the maximum ratio kh/kd in macromolecules is in the range of 7 to 10 for C-H versus C-2H, N-H versus N-2H, and O-H versus O-2H bonds. However, maximum ratios are seldom observed for a variety of reasons, but values of kh/kd in the range of 2 to 5 are common (Wiberg K. B., 1955). Deuterium located at positions in a macromolecule other than at the reaction locus can also affect the rate of a reaction. Such an effect is a secondary isotope effect and is usually much smaller than a primary isotope effect.

In general, when the macromolecules transfer to deuterated medium not only water due to the reaction of an exchange (Н2О -2Н2О) dilutes with deuterium, but also occurs a very fast isotopic (1Н-2Н)-exchange in hydroxylic (-OH), carboxilic (-COOH), sulfurhydrilic (-SH) and nitrogen (-NH; -NH2) groups of all organic compounds including the nucleic acids and proteins. It is known, that in these conditions only С-2Н bond is not exposed to isotopic exchange and thereof only the species of macromolecules with С-2H type of bonds can be synthesized de novo. This is very probably, that the most effects, observed at adaptation to 2Н2О are connected with the formation in 2Н2О [U -2H]labeled molecules with conformations having the other structural and dynamic properties, than conformations, formed with participation of hydrogen, and consequently having other activity and biophysical properties.

So, according to the theory of absolute speeds the break of С-1H-bonds can occur faster, than С-2H-bonds (C-2H-bonds are more durable than C-1 , mobility of an ion 2H+ is less, than mobility of 1Н+, the constant of ionization 2Н2О is a little bit less than ionization constant of 2Н2О. Thus, in principle, the structures of [U -2H]labeled macromolecules may to be more friable that those are forming in ordinary H2O. But, nevertheless, the stability of [U -2H]labeled macromolecules probably depending on what particular bond is labeled with deuterium (covalent bonds -C2H that causing the instability or hydrogen bonds causing the stabilization of conformation of macromolecules via forming the three-dimentional netwok of hydrogen(deuterum) bonds in macromolecule) and what precise position of the macromolecule was labeled with deuterium. For example, the very valuable and sensitive for deuterium substitution position in macromolecule is the reactive center (primary isotopic effects). The non-essential positions in macromolecule are those ones that situated far away from the reactive center of macromolecule (secondary isotopic effects). It is also possible to make a conclusion, that the sensitivity of various macromolecules to substitution on 2Н bears the individual character and depending on the structure of macromolecule itself, and thus, can be varried. From the point of view of physical chemistry, the most sensitive to replacement of 1Н+ on 2H+ can appear the apparatus of macromolecular biosyntesis and respiration system, those ones, which use high mobility of protons (deuterons) and high speed of break of hydrogen (deuterium) bonds. From that it is posible to assume, that the macromolecules should realize a special mechanisms (both at a level of primary structure and a folding of macromolecules) which could promote the stabilizition of the macromolecular structure in 2H2O and somewhat the functional reorganization of their work in 2H2O.

A principal feature of the structure of such biologically important compounds as proteins and nucleic acids is the maintenance of their structure by virtue of the participation of many hydrogen bonds in macromolecule. One may expect that the hydrogen bonds formed by of many deuterium will be different in their energy from those formed by proton. The differences in the nuclear mass of hydrogen and deuterium may possibly cause disturbances in the DNA-synthesis, leading to permanent changes in its structure and consequently in the cells genotype. The multiplication which would occur in macromolecules of even a small difference between a proton and a deuteron bond would certainly have the effect upon its structure.

The sensitivity of enzyme function to structure and the presumed sensitivity of nucleic acids function (genetic and mitotic) to its structure would lead one to expect a noticeable effect on the metabolic pattern and reproductive behavior of the organism. And next, the changes in dissociation constants of DNA and protein ionizable groups when transfer the macromolecule from water to 2H2O may perturb the charge state of the DNA and protein. Substitution of 1H for deuterium also affects the stability and geometry of hydrogen bonds in apparently rather complex way and may, through the changes in the hydrogen bond zero-point vibrational energies, alter the conformational dynamics of hydrogen (deuterium)-bonded structures within the DNA and protein in 2H2O.

CONCLUSION

The successful adaptation of organisms to high concentration of 2H2O will open a new avenues of investigation with using [U- 2H]labeled macromolecules could be isolated from these organisms. For example, fully deuterated essential macromolecules as proteins and nucleic acids will give promise of important biological, medical and diagnostical uses. Modern physical methods of study the structure of [U- 2H]labeled macromolecules, particularly three-dimentional NMR in a combination with crystallography methods, X-ray diffraction, IR-, and CD- spectroscopy should cast new light on many obscure problems concerning with the biological introduction of deuterium into molecules of DNA and proteins as well as the structure and the function of macromolecules in the presence of 2H2O. The variety of these and other aspects of biophysical properties of fully deuterated macromolecules in the presence of 2H2O remain an interesting task for the future.

First, I hope that the structural and the functional studies of [U- 2H]labeled macromolecules can provide us to the useful information about a many aspects of the synthesis of fully deuterated macromolecules and their biophysical behaviour in 2H2O.

Second, the extensive body of available structural data about a cell protection system (at the level of the structure and the functioning of [U- 2H]labeled DNA and enzymes) will also form the basis for a particularly useful model for the study of biological adaptation to 2H2O in aspect of molecular evolution of macromolecules with difined isotopic structures.

Finally, we also believe, the research can make a favour the medicine and biotechnology, especially for creating a fully deuterated analogues of enzymes and DNA having something different properties then the protonated species and working in the presence of 2H2O.

 

LITERATURE

Campbell I. D., and Dwek. Biological Spectroscopy. Benjamin/Cummings, Menlo Park, Calif. 1990.

Covington A. K., Robinson R. A., and Bates R. G. // J. Phys. Chem. 1966. V. 70. P. 3820.

Еgorova T. A., Mosin O. V., Shvets V. I., et al. // Biotechnologija. 1993. ?.8. P. 21-25.

Fesic S. W. and Zuiderweg E. R. // Quarterly Reviews of Biophysics. - 1990. - V.23. - N.2. - P. 97-131.

Johnson W. C. Protein secondary structure and circular dichroism: A practical guide. Proteins Struct. Funct. Genet. 1990. 7:205-214.

Glasoe P. K., and Long F. A. // J. Phys. Chem. 1960. V. 64. P. 188.

Hogan C. J. // Scientific American. December 1996. P. 36-41.

Karnaukhova E. N., Mosin O. V., and Reshetova O. S. // Amino Acids. 1993. V.5. ?.1.P.125.

Katz J., Crespy H. L. // Pure Appl. Chem. 1972. V. 32. P. 221-250.

Lewis G. N. // Science. 1934. V. 79. P. 151.

Mathews C. K., van Holde K. E. Biochemistry Benjamin/Cummings, Menlo Park, Calif. 1996. P. 204-210.

Mosin O. V., Karnaukhova E. N., Skladnev D. A., et al. // Biotechnologija. 1993. ?.9. P. 16-20.

Mosin O. V., Karnaukhova E. N., Pshenichnikova A. B., Reshetova O. S. Electron impact spectrometry in bioanalysis of stable isotope labeled bacteriorhodopsin. in: Sixth International Conference on Retinal Proteins. 19-24 June 1994. Leiden. The Netherlands. P.115.

Mosin O. V., Karnaukhova E. N., and Skladnev D. A. Preparation of 2H-and 13C-amino acids via bioconvertion of C1-substrates. in: 8th International Symposium on Microbial Growth on C1 Compounds. 27 August-1 September 1995. San Diego. U.S.A. P. 80.

Mosin O. V., Skladnev D. A., Egorova T. A., Yurkevich A. M., Shvets V. I. // Biotechnologija. ?3. 1996a. P. 3-12.

Mosin O. V., Egorova T. A., Chebotaev . B., Skladnev D. A., Yurkevich A. M., Shvets V. I. // Biotechnologija. 1996b. ? 4. P. 27-34.

Mosin O. V., Kazarinova L. A., Preobrazenskaya K. A., Skladnev D. A., Yurkevich A. M., Shvets V. I. // Biotechnologija. 1996c. ? 4. P. 19-26.

Mosin O. B., Skladnev D. A., Egorova T. A., Shvets V. I // Bioorganicheskaja khimia. 1996d. V. 22. N 10-11. P. 861-874.

Skladnev D. A., Mosin O. V., Egorova T. A., Eremin S. V., Shvets V. I. Methylotrophic bacteria as sourses of 2H-and 13C-amino acids. // Biotechnologija. ?5. 1996. P. 14-22.

Shvets V. I., Yurkevich A. M., Mosin O. V., Skladnev D. A // Karadeniz Journal of Medical Sciences. 1995. V.8. ? 4. P.231-232.

Thomson J. F. Biological Effects of Deuterium. 1963. Pergamon, New York.

Tomita K., Rich A., de Loze C., and Blout E. R. // J. Mol. Biol. 1962. V. 4. P. 83.

Wiberg K. B. // Chem. Rev. 1955. V. 55. P. 713.

 


1Авиация и космонавтика
2Архитектура и строительство
3Астрономия
 
4Безопасность жизнедеятельности
5Биология
 
6Военная кафедра, гражданская оборона
 
7География, экономическая география
8Геология и геодезия
9Государственное регулирование и налоги
 
10Естествознание
 
11Журналистика
 
12Законодательство и право
13Адвокатура
14Административное право
15Арбитражное процессуальное право
16Банковское право
17Государство и право
18Гражданское право и процесс
19Жилищное право
20Законодательство зарубежных стран
21Земельное право
22Конституционное право
23Конституционное право зарубежных стран
24Международное право
25Муниципальное право
26Налоговое право
27Римское право
28Семейное право
29Таможенное право
30Трудовое право
31Уголовное право и процесс
32Финансовое право
33Хозяйственное право
34Экологическое право
35Юриспруденция
36Иностранные языки
37Информатика, информационные технологии
38Базы данных
39Компьютерные сети
40Программирование
41Искусство и культура
42Краеведение
43Культурология
44Музыка
45История
46Биографии
47Историческая личность
 
48Литература
 
49Маркетинг и реклама
50Математика
51Медицина и здоровье
52Менеджмент
53Антикризисное управление
54Делопроизводство и документооборот
55Логистика
 
56Педагогика
57Политология
58Правоохранительные органы
59Криминалистика и криминология
60Прочее
61Психология
62Юридическая психология
 
63Радиоэлектроника
64Религия
 
65Сельское хозяйство и землепользование
66Социология
67Страхование
 
68Технологии
69Материаловедение
70Машиностроение
71Металлургия
72Транспорт
73Туризм
 
74Физика
75Физкультура и спорт
76Философия
 
77Химия
 
78Экология, охрана природы
79Экономика и финансы
80Анализ хозяйственной деятельности
81Банковское дело и кредитование
82Биржевое дело
83Бухгалтерский учет и аудит
84История экономических учений
85Международные отношения
86Предпринимательство, бизнес, микроэкономика
87Финансы
88Ценные бумаги и фондовый рынок
89Экономика предприятия
90Экономико-математическое моделирование
91Экономическая теория

 Анекдоты - это почти как рефераты, только короткие и смешные Следующий
Политики как сперматозоиды - из миллиона один оказывается человеком!
Anekdot.ru

Узнайте стоимость курсовой, диплома, реферата на заказ.

Обратите внимание, реферат по биологии "Зрительные молекулы", также как и все другие рефераты, курсовые, дипломные и другие работы вы можете скачать бесплатно.

Смотрите также:


Банк рефератов - РефератБанк.ру
© РефератБанк, 2002 - 2017
Рейтинг@Mail.ru